Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF19Q9UMS4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF19Q9UMS4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms