Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCC3Q9ULS5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms