Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NRXN1Q9ULB1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NRXN1Q9ULB1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NRXN1Q9ULB1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms