Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A4Q9UKG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A4Q9UKG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms