Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDC23Q9UJX2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC23Q9UJX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC23Q9UJX2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms