Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR3Q9UJK0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR3Q9UJK0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSR3Q9UJK0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms