Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP25Q9UHP3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP25Q9UHP3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms