Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRPS1Q9UHF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRPS1Q9UHF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRPS1Q9UHF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms