Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHORDC1Q9UHD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHORDC1Q9UHD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHORDC1Q9UHD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms