Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL3Q9UH77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL3Q9UH77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL3Q9UH77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms