Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA6Q9UF33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA6Q9UF33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA6Q9UF33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms