Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB4Q9UDY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJB4Q9UDY4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJB4Q9UDY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJB4Q9UDY4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJB4Q9UDY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms