Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4Q9UBX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUX4Q9UBX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms