Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRPC4Q9UBN4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms