Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGEC2Q9UBF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGEC2Q9UBF1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms