Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT4Q9P109 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCNT4Q9P109 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT4Q9P109 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms