Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPAQ9P0L0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms