Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACD3Q9P035 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms