Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNIH4Q9P003 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNIH4Q9P003 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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