Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BARHL2Q9NY43 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BARHL2Q9NY43 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BARHL2Q9NY43 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms