Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39AQ9NV64 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39AQ9NV64 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms