Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF3Q9NUQ8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms