Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM7SF3Q9NS93 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM7SF3Q9NS93 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms