Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 311.51□□□□□ -0.574e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 SCNM1-207ENST00000602841 749 ntTSL 311.26□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 UQCR10-202ENST00000401406 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.74e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 SCNM1-206ENST00000497147 862 ntTSL 210.62□□□□□ -0.714e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 SCNM1-203ENST00000459799 619 ntTSL 210.14□□□□□ -0.794e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.854e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 SCNM1-201ENST00000368902 869 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.884e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZMAT2-202ENST00000506644 735 ntTSL 38.91□□□□□ -0.984e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.644e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.734e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ACSM3-212ENST00000567711 438 ntTSL 33.13□□□□□ -1.914e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ACSM3-210ENST00000567006 520 ntTSL 23.02□□□□□ -1.934e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.024e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 220.86■□□□□ 0.932e-9■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-20■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 324.97■■□□□ 1.591e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZWINT-205ENST00000460654 830 ntTSL 315.89■□□□□ 0.132e-8■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZWINT-208ENST00000489649 1621 ntTSL 514.62□□□□□ -0.072e-8■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZWINT-209ENST00000494312 1961 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-8■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.322e-8■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZWINT-201ENST00000318387 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-8■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-8■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-218ENST00000521865 628 ntTSL 223.07■■□□□ 1.284e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-217ENST00000521067 492 ntTSL 322.41■■□□□ 1.184e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-215ENST00000520804 493 ntTSL 221.7■■□□□ 1.064e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-221ENST00000522720 593 ntTSL 417.85■□□□□ 0.454e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-210ENST00000519363 453 ntTSL 415.66■□□□□ 0.14e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-205ENST00000518196 631 ntTSL 313.89□□□□□ -0.194e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-214ENST00000520142 754 ntTSL 312.09□□□□□ -0.474e-14■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.136e-78■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 312.72□□□□□ -0.376e-78■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 512.61□□□□□ -0.396e-78■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-210ENST00000555030 749 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-204ENST00000553449 271 ntTSL 28.78□□□□□ -12e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.642e-6■■□□□ 11.8
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APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-10■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-204ENST00000524810 616 ntTSL 216.52■□□□□ 0.242e-10■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-207ENST00000526339 689 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-10■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-10■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 321.8■■□□□ 1.088e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 221.55■■□□□ 1.048e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-206ENST00000485654 428 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.733e-6■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-8■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.242e-8■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.014e-14■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-212ENST00000599256 927 ntTSL 225.75■■□□□ 1.714e-14■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 DPP7-210ENST00000483783 958 ntTSL 224.01■■□□□ 1.435e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.25e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 DPP7-206ENST00000473532 1144 ntTSL 518.78■□□□□ 0.65e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 DPP7-203ENST00000463619 775 ntTSL 315.77■□□□□ 0.125e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 DPP7-204ENST00000470766 478 ntTSL 215.05■□□□□ -05e-9■■□□□ 11.7
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APOBEC3CQ9NRW3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.445e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.037e-10■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.587e-10■■□□□ 11.7
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APOBEC3CQ9NRW3 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.827e-10■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.041e-9■■□□□ 11.7
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APOBEC3CQ9NRW3 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 TXNRD1-209ENST00000526006 502 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.391e-9■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.486e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.846e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.396e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.336e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.216e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 221.44■■□□□ 1.026e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 321.43■■□□□ 1.026e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.026e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.916e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.88■□□□□ 0.616e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.68■□□□□ 0.586e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.566e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.516e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.456e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.436e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 217.65■□□□□ 0.426e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.366e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-17■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.346e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 217.04■□□□□ 0.326e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.226e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.176e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.16e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 215.48■□□□□ 0.076e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.31■□□□□ 0.046e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 RHOT2-220ENST00000569197 530 ntTSL 513.36□□□□□ -0.276e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.286e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.36e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.36e-6■■□□□ 11.7
APOBEC3CQ9NRW3 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-6■■□□□ 11.7
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