Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMCO4Q9NRQ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMCO4Q9NRQ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms