Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF4Q9NR80 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF4Q9NR80 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARHGEF4Q9NR80 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF4Q9NR80 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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