Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX9Q9NQ69 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms