Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL40Q9NQ50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL40Q9NQ50 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL40Q9NQ50 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms