Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PALMDQ9NP74 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PALMDQ9NP74 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms