Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRM3Q9NNZ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRM3Q9NNZ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms