Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPB41L5Q9HCM4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPB41L5Q9HCM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms