Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMURF1Q9HCE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms