Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPCSQ9HAB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPCSQ9HAB8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms