Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2A7

CXCL16, C-X-C motif chemokine 16, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16Q9H2A7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL16Q9H2A7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL16Q9H2A7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL16Q9H2A7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL16Q9H2A7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL16Q9H2A7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL16Q9H2A7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL16Q9H2A7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL16Q9H2A7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms