Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPR88Q9GZN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPR88Q9GZN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms