Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA4CQ9C0C4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms