Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM5Q9C035 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms