Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM31Q9BZY9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM31Q9BZY9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM31Q9BZY9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms