Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PUS3Q9BZE2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PUS3Q9BZE2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PUS3Q9BZE2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms