Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL13Q9BYD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL13Q9BYD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL13Q9BYD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms