Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUSAP1Q9BXS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUSAP1Q9BXS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms