Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11FIP5Q9BXF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms