Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAP1Q9BWH6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPAP1Q9BWH6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms