Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM106CQ9BVX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM106CQ9BVX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms