Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THUMPD3Q9BV44 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THUMPD3Q9BV44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms