Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms