Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNPY3Q9BT09 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNPY3Q9BT09 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNPY3Q9BT09 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms