Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF8Q9BRL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms