Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FERMT1Q9BQL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FERMT1Q9BQL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FERMT1Q9BQL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FERMT1Q9BQL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FERMT1Q9BQL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FERMT1Q9BQL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FERMT1Q9BQL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms