Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA1CQ9BQE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms